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Micron Document

<!DOCTYPE html>

<title>Synechococcus</title>

</head>

<h1 id="firstHeading" class="firstHeading mw-first-heading">Synechococcus</h1>

</header>

</div>

/* start https://fr.wikipedia.org/ */

.mw-parser-output div.taxobox_v3{font-size:0.99em}.mw-parser-output div.taxobox_v3 .entete,.mw-parser-output .taxobox_v3 caption,.mw-parser-output .taxobox_v3 p.bloc{font-style:normal}.mw-parser-output .taxobox_v3 th{font-weight:normal}.mw-parser-output div.taxobox_v3.bordered th[scope=row],.mw-parser-output div.taxobox_v3.bordered td{padding-bottom:4px;border-top:1px solid #ededed}.mw-parser-output div.taxobox_v3.animal .entete{background-color:LightSalmon}.mw-parser-output .taxobox_v3.animal caption,.mw-parser-output .taxobox_v3.animal p.bloc{background-color:Bisque}.mw-parser-output div.taxobox_v3.plante .entete{background-color:lightgreen}.mw-parser-output .taxobox_v3.plante caption,.mw-parser-output .taxobox_v3.plante p.bloc{background-color:#ccffcc}.mw-parser-output div.taxobox_v3.champignon .entete{background-color:SkyBlue}.mw-parser-output .taxobox_v3.champignon caption,.mw-parser-output .taxobox_v3.champignon p.bloc{background-color:PowderBlue}.mw-parser-output div.taxobox_v3.test .entete{background-color:#50a0a0}.mw-parser-output .taxobox_v3.test caption,.mw-parser-output .taxobox_v3.test p.bloc{background-color:#70c0c0}.mw-parser-output div.taxobox_v3.algue .entete{background-color:MediumAquamarine}.mw-parser-output .taxobox_v3.algue caption,.mw-parser-output .taxobox_v3.algue p.bloc{background-color:#bfffe6}.mw-parser-output div.taxobox_v3.archaea .entete{background-color:darkgray}.mw-parser-output .taxobox_v3.archaea caption,.mw-parser-output .taxobox_v3.archaea p.bloc{background-color:lightgray}.mw-parser-output div.taxobox_v3.protiste .entete{background-color:khaki}.mw-parser-output .taxobox_v3.protiste caption,.mw-parser-output .taxobox_v3.protiste p.bloc{background-color:PaleGoldenrod}.mw-parser-output div.taxobox_v3.virus .entete{background-color:#d1d1f9}.mw-parser-output .taxobox_v3.virus caption,.mw-parser-output .taxobox_v3.virus p.bloc{background-color:Lavender}.mw-parser-output div.taxobox_v3.neutre .entete{background-color:#eee}.mw-parser-output .taxobox_v3.neutre caption,.mw-parser-output .taxobox_v3.neutre p.bloc{background-color:#eee}.mw-parser-output div.taxobox_v3.bacterie .entete,.mw-parser-output div.taxobox_v3.eucaryote .entete,.mw-parser-output div.taxobox_v3.procaryote .entete{background-color:lightgrey}.mw-parser-output .taxobox_v3.bacterie caption,.mw-parser-output .taxobox_v3.bacterie p.bloc,.mw-parser-output .taxobox_v3.eucaryote caption,.mw-parser-output .taxobox_v3.eucaryote p.bloc,.mw-parser-output .taxobox_v3.procaryote caption,.mw-parser-output .taxobox_v3.procaryote p.bloc{background-color:#e6e6e6}.mw-parser-output div.taxobox_v3 .taxobox_classification{font-style:italic}.mw-parser-output div.taxobox_v3 .taxobox_classification .rnormal,.mw-parser-output div.taxobox_v3.zoologie .taxobox_classification .normal,.mw-parser-output div.taxobox_v3 th[scope="row"]{font-style:normal}

/* end https://fr.wikipedia.org/ */

</style><div class="infobox_v3 infobox infobox--frwiki noarchive large taxobox_v3 bacterie bordered" style="width:20em">

<div>Synechococcus</div>

</div><div class="images">

</div>

<div class="legend">microscopie électronique</div><table class="taxobox_classification"><caption style=""><a href="Classification_scientifique_des_esp%C3%A8ces" title="Classification scientifique des espèces">Classification</a></caption><tbody><tr>

<th scope="row" style="width:8em;"><a href="Domaine_(biologie)" title="Domaine (biologie)">Domaine</a></th>

<td>

<a href="Bacteria" class="mw-redirect" title="Bacteria">Bacteria</a></td>

</tr>

<tr>

<th scope="row" style="width:8em;"><a href="Division_(biologie)" class="mw-redirect" title="Division (biologie)">Division</a></th>

<td>

<a href="Cyanobacteria" class="mw-redirect" title="Cyanobacteria">Cyanobacteria</a></td>

</tr>

<tr>

<th scope="row" style="width:8em;"><a href="Classe_(biologie)" title="Classe (biologie)">Classe</a></th>

<td>

<a href="Cyanophyceae" class="mw-redirect" title="Cyanophyceae">Cyanophyceae</a></td>

</tr>

<tr>

<th scope="row" style="width:8em;"><a href="Sous-classe_(biologie)" title="Sous-classe (biologie)">Sous-classe</a></th>

<td>

Synechococcophycideae</td>

</tr>

<tr>

<th scope="row" style="width:8em;"><a href="Ordre_(biologie)" title="Ordre (biologie)">Ordre</a></th>

<td>

<a href="Synechococcales" title="Synechococcales">Synechococcales</a></td>

</tr>

<tr>

<th scope="row" style="width:8em;"><a href="Famille_(biologie)" title="Famille (biologie)">Famille</a></th>

<td>

<a href="Synechococcaceae" title="Synechococcaceae">Synechococcaceae</a></td>

</tr>

</tbody></table>

<a href="Genre_(biologie)" title="Genre (biologie)">Genre</a><div class="center taxobox_classification">Synechococcus <a href="Karl_Wilhelm_von_N%C3%A4geli" title="Karl Wilhelm von Nägeli">Nägeli</a>, <a href="1849" title="1849">1849</a></div>

<a href="Esp%C3%A8ce" title="Espèce">Espèces</a> de rang inférieur

<ul><li>S. ambiguus Skuja</li>

<li>S. arcuatus var. calcicolus Fjerdingstad</li>

<li>S. bigranulatus Skuja</li>

<li>S. brunneolus Rabenhorst</li>

<li>S. caldarius Okada</li>

<li>S. capitatus A. E. Bailey-Watts & J. Komárek</li>

<li>S. carcerarius Norris</li>

<li>S. elongatus (Nägeli) Nägeli</li>

<li>S. endogloeicus F. Hindák</li>

<li>S. epigloeicus F. Hindák</li>

<li>S. ferrunginosus Wawrik</li>

<li>S. intermedius Gardner</li>

<li>S. koidzumii Yoneda</li>

<li>S. lividus Copeland</li>

<li>S. marinus Jao</li>

<li>S. minutissimus Negoro</li>

<li>S. mundulus Skuja</li>

<li>S. nidulans (Pringsheim) Komárek</li>

<li>S. rayssae Dor</li>

<li>S. rhodobaktron Komárek & Anagnostidis</li>

<li>S. roseo-persicinus Grunow</li>

<li>S. roseo-purpureus G.S. West</li>

<li>S. salinarum Komárek</li>

<li>S. salinus Frémy</li>

<li>S. sciophilus Skuja</li>

<li>S. sigmoideus (Moore & Carter) Komárek</li>

<li>S. spongiarum Usher et al.</li>

<li>S. subsalsus Skuja</li>

<li>S. sulphuricus Dor</li>

<li>S. vantieghemii (Pringsheim) Bourrelly</li>

<li>S. violaceus Grunow</li>

<li>S. viridissimus Copeland</li>

<li>S. vulcanus Copeland</li></ul></div>

</div>

Synechococcus (du grec synechos (suite) et du grec Kokkos (sphère) est un <a href="Genre_(biologie)" title="Genre (biologie)">genre</a> de <a href="Cyanobact%C3%A9rie" class="mw-redirect" title="Cyanobactérie">cyanobactéries</a> unicellulaires <a href="Nanoplancton" title="Nanoplancton">picoplanctoniques</a> (taille inférieure au <a href="Microm%C3%A8tre" title="Micromètre">micromètre</a>). Ces bactéries vivent essentiellement en mer, mais certaines espèces vivent en eau douce.

Ce genre regroupe les espèces presque les plus abondantes du milieu marin (communément de 1 000 à 200 000 cellules par millilitre d'eau de mer, voire localement jusqu'à environ 1 million de cellules/ml), et leur <a href="G%C3%A9nome" title="Génome">génome</a> serait parmi les plus abondants sur la planète<a href="#cite_note-GenoscopeCNRS-1">[1]</a>.

Bien que longtemps inconnues et encore méconnues en raison de leur taille minuscule, elles dominent quantitativement le <a href="Phytoplancton" title="Phytoplancton">phytoplancton</a> avec leurs proches parentes du genre <a href="Prochlorococcus" title="Prochlorococcus">Prochlorococcus</a> (encore plus abondant, mais moins <a href="Ubiquiste" class="mw-redirect" title="Ubiquiste">ubiquiste</a> et qui supporte moins les eaux eutrophes ou d’« <a href="Remont%C3%A9e_d'eau" title="Remontée d'eau">upwelling</a> »)<a href="#cite_note-GenoscopeCNRS-1">[1]</a>.

<div class="mw-heading mw-heading2"><h2 id="Introduction">Introduction</h2></div>

Synechococcus est l'un des genres les plus importants (en termes de quantité, et peut-être en termes de rôle écosystémique) au sein du <a href="Picoplancton" title="Picoplancton">picoplancton</a> <a href="Procaryote" class="mw-redirect" title="Procaryote">Procaryote</a> <a href="Autotrophe" class="mw-redirect" title="Autotrophe">autotrophe</a> des eaux océaniques tropicales.

La diversité de ce genre n'a cependant été découverte puis explorée qu'à partir de la fin des années 1970<a href="#cite_note-Johnson-2">[2]</a>,<a href="#cite_note-Wat79-3">[3]</a> et a été originellement défini pour inclure de « petites cyanobactéries unicellulaires dont les cellules sont ovoïdes à cylindriques et qui se reproduisent par fission binaire transversale (La cellule se « coupe » toujours perpendiculairement à l'axe le plus long de la cellule) (par pincement ou clivage) (...) →(and lack sheaths)← » <a href="#cite_note-Rip79-4">[4]</a>.

Cette définition du genre Synechococcus comprenait des organismes dont la diversité génétique était considérable. Le genre a donc été ensuite subdivisé en sous-groupes sur la base de la présence ou non d'un <a href="Pigment" title="Pigment">pigment</a> accessoire (<a href="Phyco%C3%A9rythrine" title="Phycoérythrine">phycoérythrine</a>). Une <a href="Base_de_donn%C3%A9es" title="Base de données">base de données</a> est en cours de constitution<a href="#cite_note-AlgaeBase-5">[5]</a>.

<div class="mw-heading mw-heading2"><h2 id="Description">Description</h2></div>

L'<a href="Holotype" class="mw-redirect" title="Holotype">holotype</a> qui a servi à décrire<a href="#cite_note-6">[6]</a> ce genre est Synechococcus elongatus (Nägeli)<a href="#cite_note-AlgaeBase-5">[5]</a>.

Les cyanobactéries du genre Synechococcus sont unicellulaires, photoautotrophes et vivent en cellules solitaires ou agglomérées sous forme de groupes sans qu'ils semblent former de vraies colonies (pas de <a href="Mucilage" title="Mucilage">mucilage</a> commun)<a href="#cite_note-AlgaeBase-5">[5]</a>. Leur forme est ovoïde, largement ovale ou pour certaines espèces en forme de tige arrondie aux extrémités, parfois en courbe sigmoïde. Leur contenu est homogène ou comprend des granules semblant aléatoirement dispersés ou de manière polaire. La <a href="Microscopie_%C3%A9lectronique" class="mw-redirect" title="Microscopie électronique">microscopie électronique</a> révèle souvent la présence d'inclusions de <a href="Phosphate" title="Phosphate">phosphate</a>, de granules de <a href="Glycog%C3%A8ne" title="Glycogène">glycogène</a> et surtout de <a href="Carboxysome" title="Carboxysome">carboxysomes</a> très structurés. Des <a href="Thylako%C3%AFde" title="Thylakoïde">thylakoïdes</a> sont localisées le long des parois de la cellules. Des filaments évoquant une involution de la cellule sont parfois observés)<a href="#cite_note-AlgaeBase-5">[5]</a>.

Couleur : souvent bleu pâle à vert, rarement vert-olive, bleu-vert vif ou rosé<a href="#cite_note-AlgaeBase-5">[5]</a>.

On pensait initialement que les espèces de ce genre étaient non mobiles. Certaines peuvent se mouvoir.

Leurs cellules, minuscules, mesurent de 0,6 à 1,6 <abbr class="abbr" title="micromètre">µm</abbr>. Ils sont <a href="Gram_n%C3%A9gatif" title="Gram négatif">gram négatif</a>.

Les cellules présentent des parois cellulaires très structurées (<a href="Ultrastructure" title="Ultrastructure">ultrastructures</a>)<a href="#cite_note-7">[7]</a>.

Les cellules-filles grandissent et se reproduisent lorsqu'elles ont atteint une taille plus ou moins similaire à celle de la cellule mère. Après une division, les cellules physiologiquement séparées peuvent rester un certain temps disposées en rangées et former un pseudofilament de plusieurs cellules indépendantes, mais provisoirement liées par leurs extrémités. En conditions optimales apparaissent des cellules allongées d'aspect filamenteux, capables de se diviser de manière asymétrique<a href="#cite_note-AlgaeBase-5">[5]</a>.

Les cellules <a href="Photosynth%C3%A8se" title="Photosynthèse">photosynthétiques</a> sont rencontrées préférentiellement dans les eaux de surface bien éclairées où cette bactérie est très abondante, mais les cellules présentent plusieurs caractéristiques adaptatives ;

<ul><li>possibilité d'adapter leur métabolisme à des eaux plus profondes et moins lumineuses<a href="#cite_note-GenoscopeCNRS-1">[1]</a> ;</li>

<li>en zone <a href="Oligotrophe" title="Oligotrophe">oligotrophe</a> marine, la bactérie est capable de capter des minéraux présents dans l'eau à des concentrations moindres qu'une <a href="Micromole" class="mw-redirect" title="Micromole">micromole</a> par litre. Dans ces zones où le fer est rare, cet <a href="Oligo%C3%A9l%C3%A9ment" class="mw-redirect" title="Oligoélément">oligoélément</a> constituant d'enzymes vitaux est remplacé par d'autres métaux (nickel notamment)<a href="#cite_note-GenoscopeCNRS-1">[1]</a>. En outre, l'« antenne photosynthétique » (<a href="Phycobilisome" title="Phycobilisome">phycobilisome</a>) s'adapte à différents spectres lumineux, en biosynthétisant des pigments photosynthétiques inconnus chez les autres genres<a href="#cite_note-GenoscopeCNRS-1">[1]</a> ;</li>

<li>on a découvert chez plusieurs souches vivant en haute mer un mode de locomotion totalement différent de celui d'autres bactéries utilisant un ou plusieurs cils ou flagelles. Ces souches contiennent aussi des organelles différents et leur mouvement semble rétroagir non pas selon le gradient lumineux, mais à de subtiles variations des taux de composés azotés en solution<a href="#cite_note-GenoscopeCNRS-1">[1]</a>.</li></ul>

Plusieurs espèces croissent en formant des structures en nattes ou en formant d'autres types de colonies algales, ou bien en colonisant des substrats mouillés (boue, bois, pierres, etc.)<a href="#cite_note-AlgaeBase-5">[5]</a> ;

Un groupe d'espèces est connu pour se développer dans le metaphyton et périphyton de sources thermales et minérales, peu d'espèces ont à ce jour été découvertes sur des sites aerophytiques<a href="#cite_note-AlgaeBase-5">[5]</a>.

Des espèces picoplanctoniques ou planctoniques ont été trouvées dans les océans et dans des lacs (S. rhodobactron et d'autres).

<div class="mw-heading mw-heading2"><h2 id="Pigments">Pigments</h2></div>

Le principal <a href="Pigment_photosynth%C3%A9tique" title="Pigment photosynthétique">pigment photosynthétique</a> de Synechococcus est la <a href="Chlorophylle_a" title="Chlorophylle a">chlorophylle a</a>, mais divers pigments « accessoires » (<a href="Phycobilliprot%C3%A9ine" class="mw-redirect" title="Phycobilliprotéine">phycobilliprotéines</a>) peuvent être synthétisés par ces bactéries<a href="#cite_note-Wat79-3">[3]</a>. Les quatre <a href="Phycobiline" title="Phycobiline">phycobilines</a> communément reconnues sont la <a href="Phycocyanine" title="Phycocyanine">phycocyanine</a>, l'<a href="Allophycocyanine" title="Allophycocyanine">allophycocyanine</a>, l'allophycocyanine B et la phytoérythrine (aussi retrouvée chez des <a href="Rhodophyte" class="mw-redirect" title="Rhodophyte">Rhodophytes</a> et certains <a href="Cryptophyta" title="Cryptophyta">Cryptophytas</a>)<a href="#cite_note-8">[8]</a>.

En outre Synechococcus synthétise aussi de la <a href="Z%C3%A9axanthine" title="Zéaxanthine">zéaxanthine</a> (également trouvée chez le genre proche <a href="Prochlorococcus" title="Prochlorococcus">Prochlorococcus</a>, chez les <a href="Algues_rouges" class="mw-redirect" title="Algues rouges">algues rouges</a> et comme pigments mineurs dans certains <a href="Chlorophyta" title="Chlorophyta">Chlorophytes</a> et Eustigmatophytes)<a href="#cite_note-AlgaeBase-5">[5]</a>.

<div class="mw-heading mw-heading2"><h2 id="Diversité_génétique_et_classification">Diversité génétique et classification</h2></div>

Mi-2009, il y avait 75 noms d'espèces dans la base de données du <a href="Genoscope" title="Genoscope">genoscope</a>, mais seuls 34 étaient officiellement reconnues sur le plan taxonomique<a href="#cite_note-AlgaeBase-5">[5]</a>.

Depuis le <time class="nowrap" datetime="2009-06-02" data-sort-value="2009-06-02">2 juin 2009</time>, des données sur les séquences nucléotidiques sont disponibles sur la <a rel="nofollow" class="external text" href="https://www.ncbi.nlm.nih.gov/Genbank">Banque de données de Genbank</a>, pour (en 2009) plus de 4 830 échantillons identifiés comme Synechococcus (avec de possibles erreurs pour l'identification taxonomique de certains de ces échantillons (espèce, voire genre) non accompagnés d'indication décrivant finement les spécimens<a href="#cite_note-9">[9]</a>.

Le premier Synechococcus dont le génome a été publié (WH8102<a href="#cite_note-10">[10]</a>) est une souche mobile vivant dans des zones oligotrophes de l'océan ; son génome est de 2,4 Mpb<a href="#cite_note-GenoscopeCNRS-1">[1]</a>.

De nombreuses espèces d'eau douce ont été décrites, dont certaines vivent dans des milieux extrêmes, par exemple <a href="Hyperthermophile" class="mw-redirect" title="Hyperthermophile">hyperthermophiles</a>.

La <a href="Taille_du_g%C3%A9nome" title="Taille du génome">taille du génome</a> (nombre de paires de base) varie selon les espèces ; celui de la souche (PCC7002) de Synechococcus elongatus a une taille de 2,7 Mpb<a href="#cite_note-AlgaeBase-5">[5]</a>;

Selon le génoscope, les Synechococcus marins diffèrent phylogénétiquement fortement des Synechococcus connus en eau douce ou hydrothermales, alors que les Synechococcus spp. marins et l’ensemble du genre <a href="Prochlorococcus" title="Prochlorococcus">Prochlorococcus</a> forment un groupe monophylétique.

Le genre est certainement hétérogène et sa taxonomie doit être révisée à l'aide de méthodes ultrastructurales et de taxonomie et phylogénie moléculaires. Le « Marine groupe A » (« Marine cluster A ») de bactéries photoautotrophes, à cellules mobiles, à contenu cellulaire rougeâtre et adaptation chromatique comp. Waterbury 1989) constitue sans doute un genre botanique à part (non encore révisé) <a href="#cite_note-AlgaeBase-5">[5]</a>.

Parce que certaines souches se cultivent bien dans différents types de cultures, que ces espèces semblent avoir des fonctions écologiques majeures, et parce que certaines présentent des résistances adaptatives étonnantes (notamment thermophiles Synechococcus lividus, et Synechococcus bigranulatus, etc.), certaines Synechococcus pourraient devenir un important « <a href="Organisme_mod%C3%A8le" title="Organisme modèle">organisme modèle</a> » de laboratoire, notamment pour étudier la <a href="S%C3%A9questration_du_carbone" class="mw-redirect" title="Séquestration du carbone">séquestration du carbone</a> par le nanoplancton, voire pour servir de support au <a href="G%C3%A9nie_g%C3%A9n%C3%A9tique" title="Génie génétique">génie génétique</a><a href="#cite_note-GenoscopeCNRS-1">[1]</a>.

<div class="mw-heading mw-heading2"><h2 id="Phylogénie">Phylogénie</h2></div>

La description <a href="Phylog%C3%A9n%C3%A9tique" class="mw-redirect" title="Phylogénétique">phylogénétique</a> des Synechococcus est rendue délicate par le fait qu'il s'agit encore d'un taxon provisoire regroupant des espèces encore peu connues (et probablement d'autres encore inconnues), et parce que de nombreux isolats, bien que <a href="Morphologie_(biologie)" title="Morphologie (biologie)">morphologiquement</a> très similaires, présentent de fortes différences génétiques (G + C allant de 39 % à 71 %)<a href="#cite_note-Wat86b-11">[11]</a>.

On a d'abord tenté de subdiviser ce groupe en trois sous-groupes, chacun ayant une gamme spécifique de génomique de G + C<a href="#cite_note-12">[12]</a>. Le manuel de Bergey (Herdmanet al.2001) divise désormais (et provisoirement) le genre Synechococcus en cinq groupes (chacun équivalent à un genre), sur la base de critères de morphologie, physiologie et traits génétiques.

<ul><li>Un premier groupe (Cluster 1) contient les espèces les plus grandes du groupe (1 à 1,5 <abbr class="abbr" title="micromètre">µm</abbr>), non mobiles, photoautotrophes obligatoires et présentant une faible tolérance au sel. Les souches de référence pour ce groupe sont PCC6301 (antérieurement nommée Anacycstis nidulans) et PCC6312 ; respectivement isolées en eau douce au <a href="Texas" title="Texas">Texas</a> et en <a href="Californie" title="Californie">Californie</a><a href="#cite_note-Rip79-4">[4]</a>.</li>

<li>Le second groupe (Cluster 2) est également caractérisé par une faible tolérance au sel, et une photoautrotrophie obligatoire, avec absence de phycoérythrine et thermophilie. PCC6715 est la souche de référence, isolé dans une source chaude du <a href="Parc_national_de_Yellowstone" title="Parc national de Yellowstone">Parc national de Yellowstone</a><a href="#cite_note-13">[13]</a>.</li>

<li>Le groupe 3 (Cluster 3) comprend des Synechococcus marins ne produisant pas de phycoérythrine et qui sont euryhalins (c'est-à-dire capable de croître à la fois en eau douce et salée). Plusieurs souches, dont la souche de référence PCC7003 sont hétérotrophes facultatives, et ont besoin de vitamine B12 pour leur croissance.</li>

<li>Le groupe 4 (Cluster 4) ne contient qu'un seul isolat, PCC7335 qui est une souche exclusivement marine<a href="#cite_note-14">[14]</a>. Cette souche contient de la phycoerthrine et a d'abord été isolée de la zone intertidale à <a href="Puerto_Pe%C3%B1asco" title="Puerto Peñasco">Puerto Peñasco</a> (<a href="Mexique" title="Mexique">Mexique</a>) <a href="#cite_note-Rip79-4">[4]</a>.</li>

<li>Le groupe 5 (Cluster 5) contient un groupe antérieurement dénommé « groupes marins A et B » de Synechococcus. Ces cellules sont exclusivement marines et ont été isolées à la fois sur des littoraux et dans l'océan ouvert. Toutes les souches sont photoautrophes obligatoires et ont une taille de 0,6 à 1,7 µm de diamètre. Ce cluster a été subdivisé en une population qui contient une ou l'autre (Cluster 5.1) ou ne contient pas (Cluster 5.2) de phycoérythrine. Les souches de référence sont WH8103 pour le groupe contenant de la phycoérythrine et WH5701 pour les souches n'en synthétisant pas (Waterburyet al.1986b). Plus récemment Badger a proposé la division des cyanobactéries dans des subclusters α-et β sur la base de leur manière de concentrer le CO2, via les différences entre les types de gène RBCL (large subunit of ribulose 1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase) détectés dans ces organismes<a href="#cite_note-15">[15]</a> les α-cyanobactéries étant celles qui contiennent une forme IA, les β-cyanobactéries étant celles qui contiennent une forme dite IB de ce gène. En s'appuyant sur cette division, Badger a analysé la phylogénie de certaines protéines carboxysomales (impliquées dans les carboxysomes, et donc dans la capacité à capter le CO2) qui semblent soutenir cette division. Par ailleurs, deux systèmes particulier de transport du bicarbonate ne semblent être trouvés que chez les α-cyanobactéries, qui ne produisent pas d'enzymes "carboxysomal carbonic anhydrases".</li></ul>

<div class="mw-heading mw-heading2"><h2 id="Mobilité">Mobilité</h2></div>

Les cellules de certaines espèces de ce genre sont motiles, bien que dépourvues de <a href="Flagelle" title="Flagelle">flagelles</a> de <a href="Cil_cellulaire" title="Cil cellulaire">cils</a> ou d'autres moyens apparents de déplacement.

On a observé des fragments de <a href="Colonie" title="Colonie">colonie</a> s'en éloignant à une vitesse de 10 <a href="Microm%C3%A8tre" title="Micromètre">micromètres</a> par seconde. Certaines colonies emprisonnent des bulles qui les font flotter et leur permettent d'être emportées par le courant. Certaines cyanobactéries sont parfois animées de mouvements saccadés.

La mobilité semble dépendre de trois types de phénomènes

<ul><li>reptation linéaire<a href="#cite_note-16">[16]</a>, Certaines cyanophycées sont mobiles, glissant ou pivotant, semble-t-il au moyen d'ondes de contraction</li>

<li>par un autre mode de « nage » (gliding motility pour les anglophones), mal compris, non « photo-tactique »<a href="#cite_note-17">[17]</a> qui n'implique pas de mouvement de flagelle. Il pourrait s'agir d'un phénomène d'extrusion différentiée de mucilage, permettant à la bactérie de se mouvoir autour de son axe (longitudinal).</li>

<li>production (par certaines espèces) de vésicules gazeuses leur permettant de monter ou descendre dans la colonne d'eau, et de coloniser la surface de l'eau (au détriment d'autres espèces) quand les conditions (eaux calmes, chaleur…) leur sont favorables (c'est l'origine de certains <a href="Blooms_planctoniques" class="mw-redirect" title="Blooms planctoniques">blooms planctoniques</a>).</li></ul>

<div class="mw-heading mw-heading2"><h2 id="Écologie_et_distribution">Écologie et distribution</h2></div>

Les cyanobactéries du genre Synechococcus ont été observées à des concentrations variant d'un très petit nombre de cellules par ml d'eau à 10 6 cellules/ml dans presque toutes les régions de la zone euphotique océanique sauf dans les échantillons provenant de la <a href="McMurdo_Sound" class="mw-redirect" title="McMurdo Sound">McMurdo Sound</a> et <a href="Ross_Ice_Shelf" class="mw-redirect" title="Ross Ice Shelf">Ross Ice Shelf</a> en <a href="Antarctique" title="Antarctique">Antarctique</a><a href="#cite_note-Wat86b-11">[11]</a>. Ces bactéries sont plus abondantes dans les milieux eutrophes (riches en éléments nutritifs) que dans l'océan oligotrophe et elles préfèrent la partie supérieure bien éclairée de la zone euphotique<a href="#cite_note-Par99a-18">[18]</a>.

Quelques pullulations ont été observées dans des eaux peu salées ou froides.

Le genre Synechococcus est habituellement moins présent en nombre de bactéries par volume d'eau que les Prochlorococcus, dans tous les milieux où ils coexistent, avec quelques exceptions dans les zones continuellement enrichies en nutriments telles que les <a href="Remont%C3%A9e_d'eau" title="Remontée d'eau">remontées d'eau froide</a> (upwelling en anglais) et les <a href="Bassins_versants" class="mw-redirect" title="Bassins versants">bassins versants</a> sous-marin côtiers du <a href="Plateau_continental_(g%C3%A9ophysique)" class="mw-redirect" title="Plateau continental (géophysique)">plateau continental</a><a href="#cite_note-Par99a-18">[18]</a>. Dans les zones pauvres en nutriments telles que les <a href="Gyre" class="mw-redirect" title="Gyre">gyres</a> centraux des océans, Synechococcus est apparemment toujours là, mais à de faibles concentrations (allant de presque rien à environ 4 × 10³ cellules par ml<a href="#cite_note-19">[19]</a>,<a href="#cite_note-20">[20]</a>,<a href="#cite_note-21">[21]</a>,<a href="#cite_note-22">[22]</a>,<a href="#cite_note-23">[23]</a>.

Verticalement (dans la colonne d'eau) les cyanobactéries du genre Synechococcus sont généralement assez homogènement réparties dans la couche de mélange (en surface) et présentent une affinité pour les régimes plus légers.

Sous la couche de mélange, les concentrations cellulaires diminuent rapidement avec la profondeur.

Les profils sont toutefois fortement influencées par les conditions hydrologiques et peuvent fortement varier avec les saisons (ainsi que spatialement). Globalement, l'abondance de Synechococcus est souvent parallèle avec celle des Prochlorococcus dans la colonne d'eau.

<div class="mw-heading mw-heading2"><h2 id="Capacité_à_fixer_le_carbone">Capacité à fixer le carbone</h2></div>

Individuellement, elles ne fixent que peu de carbone, mais le nombre immense de ces bactéries dans l'océan fait qu'elles jouent un rôle important pour la fixation océanique du carbone<a href="#cite_note-GenoscopeCNRS-1">[1]</a>.

<div class="mw-heading mw-heading2"><h2 id="Capacité_à_fixer_l'azote_de_l'air_ou_de_l'eau">Capacité à fixer l'azote de l'air ou de l'eau</h2></div>

Alors que certaines cyanobactéries sont capables de photohétérotrophie voire d'une croissance chemohétérotrophique, toutes les souches marines connues de Synechococcus semblent être photo-autotrophes obligées<a href="#cite_note-Wat86b-11">[11]</a> ; elles sont capables de pourvoir à leurs besoins en azote en utilisant les nitrates, l'ammoniaque ou même parfois directement de l'<a href="Ur%C3%A9e" title="Urée">urée</a> comme seule source d'azote. On a longtemps cru que les Synechococcus marins n'étaient pas capables de fixer l'azote, mais cette perception pourrait changer.

<div class="mw-heading mw-heading2"><h2 id="Notes_et_références">Notes et références</h2></div>

<li id="cite_note-GenoscopeCNRS-1"><a rel="nofollow" class="external text" href="http://www.genoscope.cns.fr/spip/Synechococcus-cyanobacteries.html">Page du Génoscope/CNRS consacrée à ce genre</a>

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<li id="cite_note-Johnson-2"><a href="#cite_ref-Johnson_2-0">↑</a> Johnson, P. W. & Sieburth, J. M. 1979. Chroococcoid cyanobacteria in the sea: a ubiquitous and diverse phototrophic biomass. Limnol. Oceanogr. 24:928-935.

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<li id="cite_note-6"><a href="#cite_ref-6">↑</a> Publication originale : Nägeli, C. (1849). Gattungen einzelliger Algen, physiologisch und systematisch bearbeitet. Neue Denkschriften der Allg. Schweizerischen Gesellschaft für die Gesammten Naturwissenschaften 10(7): i-viii, 1-139, pls I-VIII.

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<li id="cite_note-9"><a href="#cite_ref-9">↑</a> référence donnée : Harvey et al. 2009. Plusieurs publications sont possibles, la plus proche du sujet semble être celle-ci :

[Harvey et al. 2009] <abbr class="abbr indicateur-langue" title="Langue : anglais">(en)</abbr> David J. Harvey, Anthony H. Merry, Louise Royle, Matthew P. Campbell, Raymond A. Dwek et Pauline M. Rudd, « <cite style="font-style:normal" lang="en">Proposal for a standard system for drawing structural diagrams of N- and O-linked carbohydrates and related compounds</cite> », Proteomics, <abbr class="abbr" title="volume">vol.</abbr> 9,‎ <time class="nowrap" datetime="2009-08" data-sort-value="2009-08">août 2009</time>, <abbr class="abbr" title="pages">p.</abbr> 3796-3801 (<a href="Digital_Object_Identifier" title="Digital Object Identifier">DOI</a> <a rel="nofollow" class="external text" href="https://dx.doi.org/10.1002/pmic.200900096">10.1002/pmic.200900096</a>)<span class="Z3988" title="ctx_ver=Z39.88-2004&rft_val_fmt=info%3Aofi%2Ffmt%3Akev%3Amtx%3Ajournal&rft.genre=article&rft.atitle=Proposal+for+a+standard+system+for+drawing+structural+diagrams+of+N-+and+O-linked+carbohydrates+and+related+compounds&rft.jtitle=Proteomics&rft.aulast=Harvey&rft.aufirst=David+J.&rft.au=Anthony+H.+Merry&rft.au=Louise+Royle&rft.au=Matthew+P.+Campbell&rft.au=Raymond+A.+Dwek&rft.au=Pauline+M.+Rudd&rft.date=2009-08&rft.volume=9&rft.pages=3796-3801&rft_id=info%3Adoi%2F10.1002%2Fpmic.200900096&rfr_id=info%3Asid%2Ffr.wikipedia.org%3ASynechococcus">.

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<li id="cite_note-10"><a href="#cite_ref-10">↑</a> <abbr class="abbr indicateur-langue" title="Langue : anglais">(en)</abbr> B. Palenik <abbr class="abbr" title="et alii (et d’autres)">et al.</abbr>, « <cite style="font-style:normal" lang="en">The genome of a motile marine Synechococcus</cite> », Nature, <abbr class="abbr" title="volume">vol.</abbr> 424, <abbr class="abbr" title="numéro">no</abbr> 6952,‎ <time class="nowrap" datetime="2003-08" data-sort-value="2003-08">août 2003</time>, <abbr class="abbr" title="pages">p.</abbr> 1037-1042 (<a href="Digital_Object_Identifier" title="Digital Object Identifier">DOI</a> <a rel="nofollow" class="external text" href="https://dx.doi.org/10.1038/nature01943">10.1038/nature01943</a>)<span class="Z3988" title="ctx_ver=Z39.88-2004&rft_val_fmt=info%3Aofi%2Ffmt%3Akev%3Amtx%3Ajournal&rft.genre=article&rft.atitle=The+genome+of+a+motile+marine+%27%27Synechococcus%27%27&rft.jtitle=Nature&rft.issue=6952&rft.aulast=Palenik&rft.aufirst=B.&rft.date=2003-08&rft.volume=424&rft.pages=1037-1042&rft_id=info%3Adoi%2F10.1038%2Fnature01943&rfr_id=info%3Asid%2Ffr.wikipedia.org%3ASynechococcus">.

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<li id="cite_note-20"><a href="#cite_ref-20">↑</a> [Olson et al. 1990] <abbr class="abbr indicateur-langue" title="Langue : anglais">(en)</abbr> Robert J. Olson, Sallie W. Chisholm, Erik R. Zettler et E. Virginia Armbrust, « <cite style="font-style:normal" lang="en">Pigment size and distribution of Synechococcus in the North Atlantic and Pacific oceans</cite> », Limnology and Oceanography, <abbr class="abbr" title="volume">vol.</abbr> 35, <abbr class="abbr" title="numéro">no</abbr> 1,‎ <time>1990</time>, <abbr class="abbr" title="pages">p.</abbr> 45-58 (<a rel="nofollow" class="external text" href="https://aslopubs.onlinelibrary.wiley.com/doi/pdf/10.4319/lo.1990.35.1.0045">lire en ligne</a> [sur aslopubs.onlinelibrary.wiley.com], consulté en <time class="nowrap" datetime="2024-07" data-sort-value="2024-07">juillet 2024</time>)<span class="Z3988" title="ctx_ver=Z39.88-2004&rft_val_fmt=info%3Aofi%2Ffmt%3Akev%3Amtx%3Ajournal&rft.genre=article&rft.atitle=Pigment+size+and+distribution+of+Synechococcus+in+the+North+Atlantic+and+Pacific+oceans&rft.jtitle=Limnology+and+Oceanography&rft.issue=1&rft.aulast=Olson&rft.aufirst=Robert+J.&rft.au=Sallie+W.+Chisholm&rft.au=Erik+R.+Zettler&rft.au=E.+Virginia+Armbrust&rft.date=1990&rft.volume=35&rft.pages=45-58&rfr_id=info%3Asid%2Ffr.wikipedia.org%3ASynechococcus">.

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<li id="cite_note-21"><a href="#cite_ref-21">↑</a> [Blanchot, Rodier & LeBouteiller 1992] <abbr class="abbr indicateur-langue" title="Langue : anglais">(en)</abbr> Jean Blanchot, Martine Rodier et Aubert Le Bouteiller, « <cite style="font-style:normal" lang="en">Effect of El Niño Southern Oscillation events on the distribution and abundance of phytoplankton in the Western Pacific Tropical Ocean along 165°E</cite> », Journal of Plankton Research, <abbr class="abbr" title="volume">vol.</abbr> 14, <abbr class="abbr" title="numéro">no</abbr> 1,‎ <time class="nowrap" datetime="1992-01" data-sort-value="1992-01">janvier 1992</time>, <abbr class="abbr" title="pages">p.</abbr> 137-156 (<a href="Digital_Object_Identifier" title="Digital Object Identifier">DOI</a> <a rel="nofollow" class="external text" href="https://dx.doi.org/10.1093/plankt/14.1.137">10.1093/plankt/14.1.137</a>, <a rel="nofollow" class="external text" href="https://www.researchgate.net/publication/32976733_Effect_of_El_Nio_Southern_Oscillation_events_on_the_distribution_and_abundance_of_phytoplankton_in_the_Western_Pacific_Tropical_Ocean_along_165E">lire en ligne</a> [sur researchgate.net])<span class="Z3988" title="ctx_ver=Z39.88-2004&rft_val_fmt=info%3Aofi%2Ffmt%3Akev%3Amtx%3Ajournal&rft.genre=article&rft.atitle=Effect+of+El+Ni%C3%B1o+Southern+Oscillation+events+on+the+distribution+and+abundance+of+phytoplankton+in+the+Western+Pacific+Tropical+Ocean+along+165%C2%B0E&rft.jtitle=Journal+of+Plankton+Research&rft.issue=1&rft.aulast=Blanchot&rft.aufirst=Jean&rft.au=Martine+Rodier&rft.au=Aubert+Le+Bouteiller&rft.date=1992-01&rft.volume=14&rft.pages=137-156&rft_id=info%3Adoi%2F10.1093%2Fplankt%2F14.1.137&rfr_id=info%3Asid%2Ffr.wikipedia.org%3ASynechococcus">.

</li>

<li id="cite_note-22"><a href="#cite_ref-22">↑</a> [Campbell & Vaulot 1993] <abbr class="abbr indicateur-langue" title="Langue : anglais">(en)</abbr> Lisa Campbell et Daniel Vaulot, « <cite style="font-style:normal" lang="en">Photosynthetic picoplankton community structure in the stubtropical North Pacific Ocean new Hawaii (station ALOHA)</cite> », Deep Sea Research Part I: Oceanographic Research Papers, <abbr class="abbr" title="volume">vol.</abbr> 40, <abbr class="abbr" title="numéro">no</abbr> 10,‎ <time>1993</time>, <abbr class="abbr" title="pages">p.</abbr> 2043-2060 (<a href="Digital_Object_Identifier" title="Digital Object Identifier">DOI</a> <a rel="nofollow" class="external text" href="https://dx.doi.org/10.1016/0967-0637%2893%2990044-4">10.1016/0967-0637(93)90044-4</a>, <a rel="nofollow" class="external text" href="https://daniel-vaulot.fr/files/papers/Campbell_Vaulot_1993.pdf">lire en ligne</a> <abbr class="abbr indicateur-format format-pdf" title="Document au format Portable Document Format (PDF) d'Adobe">[PDF]</abbr> sur daniel-vaulot.fr, consulté en <time class="nowrap" datetime="2024-07" data-sort-value="2024-07">juillet 2024</time>)<span class="Z3988" title="ctx_ver=Z39.88-2004&rft_val_fmt=info%3Aofi%2Ffmt%3Akev%3Amtx%3Ajournal&rft.genre=article&rft.atitle=Photosynthetic+picoplankton+community+structure+in+the+stubtropical+North+Pacific+Ocean+new+Hawaii+%28station+ALOHA%29&rft.jtitle=Deep+Sea+Research+Part+I%3A+Oceanographic+Research+Papers&rft.issue=10&rft.aulast=Campbell&rft.aufirst=Lisa&rft.au=Daniel+Vaulot&rft.date=1993&rft.volume=40&rft.pages=2043-2060&rft_id=info%3Adoi%2F10.1016%2F0967-0637%2893%2990044-4&rfr_id=info%3Asid%2Ffr.wikipedia.org%3ASynechococcus">.

</li>

<li id="cite_note-23"><a href="#cite_ref-23">↑</a> [Blanchot & Rodier 1996] <abbr class="abbr indicateur-langue" title="Langue : anglais">(en)</abbr> Jean Blanchot et Martine Rodier, « <cite style="font-style:normal" lang="en">Picophytoplankton abundance and biomass in the western tropical Pacific Ocean during the 1992 El Nino year: results from flow cytometry</cite> », Deep Sea Research Part I: Oceanographic Research Papers, <abbr class="abbr" title="volume">vol.</abbr> 43, <abbr class="abbr" title="numéro">no</abbr> 6,‎ <time class="nowrap" datetime="1996-07" data-sort-value="1996-07">juillet 1996</time>, <abbr class="abbr" title="pages">p.</abbr> 877-895 (<a href="Digital_Object_Identifier" title="Digital Object Identifier">DOI</a> <a rel="nofollow" class="external text" href="https://dx.doi.org/10.1016/0967-0637%2896%2900026-X">10.1016/0967-0637(96)00026-X</a>, <a rel="nofollow" class="external text" href="https://www.academia.edu/116983023/Picophytoplankton_abundance_and_biomass_in_the_western_tropical_Pacific_Ocean_during_the_1992_El_Ni%C3%B1o_year_results_from_flow_cytometry">lire en ligne</a> [sur academia.edu])<span class="Z3988" title="ctx_ver=Z39.88-2004&rft_val_fmt=info%3Aofi%2Ffmt%3Akev%3Amtx%3Ajournal&rft.genre=article&rft.atitle=Picophytoplankton+abundance+and+biomass+in+the+western+tropical+Pacific+Ocean+during+the+1992+El+Nino+year%3A+results+from+flow+cytometry&rft.jtitle=Deep+Sea+Research+Part+I%3A+Oceanographic+Research+Papers&rft.issue=6&rft.aulast=Blanchot&rft.aufirst=Jean&rft.au=Martine+Rodier&rft.date=1996-07&rft.volume=43&rft.pages=877-895&rft_id=info%3Adoi%2F10.1016%2F0967-0637%2896%2900026-X&rfr_id=info%3Asid%2Ffr.wikipedia.org%3ASynechococcus">.

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<div class="mw-heading mw-heading2"><h2 id="Voir_aussi">Voir aussi</h2></div>

/* start https://fr.wikipedia.org/ */

.mw-parser-output .autres-projets>.titre{text-align:center;margin:0.2em 0}.mw-parser-output .autres-projets>ul{margin:0;padding:0}.mw-parser-output .autres-projets>ul>li{list-style:none;margin:0.2em 0;text-indent:0;padding-left:24px;min-height:20px;text-align:left;display:block}.mw-parser-output .autres-projets>ul>li>a{font-style:italic}@media(max-width:720px){.mw-parser-output .autres-projets{float:none}}

/* end https://fr.wikipedia.org/ */

</style>

<div class="mw-heading mw-heading3"><h3 id="Articles_connexes">Articles connexes</h3></div>

<ul><li><a href="Bact%C3%A9rioplancton" title="Bactérioplancton">Bactérioplancton</a></li>

<li><a href="Phytoplancton" title="Phytoplancton">Phytoplancton</a></li>

<li><a href="Nanoplancton" title="Nanoplancton">Nanoplancton</a></li>

<li><a href="Picoplancton_photosynth%C3%A9tique" title="Picoplancton photosynthétique">Picoplancton photosynthétique</a></li>

<li><a href="Cyanobact%C3%A9ries" class="mw-redirect" title="Cyanobactéries">Cyanobactéries</a></li>

<li><a href="Cycle_biog%C3%A9ochimique" title="Cycle biogéochimique">Cycle biogéochimique</a></li>

<li><a href="Cycle_du_carbone" title="Cycle du carbone">Cycle du carbone</a></li>

<li><a href="Cycle_de_l'azote" title="Cycle de l'azote">Cycle de l'azote</a></li>

<li><a href="Prochlorococcus" title="Prochlorococcus">Prochlorococcus</a></li>

<li><a href="Plancton" title="Plancton">Plancton</a></li></ul>

</div>

<div class="mw-heading mw-heading3"><h3 id="Liens_externes">Liens externes</h3></div>

<ul><li><abbr class="abbr indicateur-langue" title="Langue : anglais">(en)</abbr> <a href="AlgaeBase" title="AlgaeBase">AlgaeBase</a> : <a rel="nofollow" class="external text" href="http://www.algaebase.org/search/genus/detail/?genus_id=43582">genre Synechococcus Nägeli, 1849</a></li>

<li><abbr class="abbr indicateur-langue" title="Langue : anglais">(en)</abbr> <a href="Catalogue_of_Life" title="Catalogue of Life">Catalogue of Life</a> : <a rel="nofollow" class="external text" href="https://www.catalogueoflife.org/data/taxon/7R7J">Synechococcus Nägeli</a> (consulté le <time class="nowrap" datetime="2025-01-11" data-sort-value="2025-01-11">11 janvier 2025</time>)</li>

<li><abbr class="abbr indicateur-langue" title="Langues : français et anglais">(fr + en)</abbr> <a href="Syst%C3%A8me_d'information_taxonomique_int%C3%A9gr%C3%A9" title="Système d'information taxonomique intégré">ITIS</a> : <a rel="nofollow" class="external text" href="https://www.itis.gov/servlet/SingleRpt/SingleRpt?search_topic=TSN&search_value=773">Synechococcus Nageli, 1849</a></li>

<li><abbr class="abbr indicateur-langue" title="Langue : anglais">(en)</abbr> <a href="National_Center_for_Biotechnology_Information" title="National Center for Biotechnology Information">NCBI</a> : <a rel="nofollow" class="external text" href="https://www.ncbi.nlm.nih.gov/Taxonomy/Browser/wwwtax.cgi?mode=Info&id=1129">Synechococcus </a> (<a rel="nofollow" class="external text" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Taxonomy/Browser/wwwtax.cgi?lin=s&p=has_linkout&id=1129">taxons inclus</a>)</li></ul>

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